O HC aderiu à gestão compartilhada com a Ebserh – estatal vinculada ao Ministério da Educação (MEC) – em 30 de outubro de 2014. O contrato de gestão prevê a implantação de um plano de reestruturação da unidade hospitalar, ação executada de forma conjunta entre a Universidade e a Empresa. A principal medida contida no plano é a recomposição do quadro de pessoal, por meio de concurso público, permitindo a reativação de unidades e de leitos e a ampliação dos serviços de saúde oferecidos, exclusivamente, via SUS à população.
O último concurso realizado para o Hospital de Clínicas ocorreu em 2003. Desde então, apenas reposições paliativas de servidores aposentados, falecidos e exonerados foram feitas. Com o déficit no quadro de pessoal, o Hospital de Clínicas forçou-se a diminuir, progressivamente, a sua capacidade de atendimento com a consequente desativação de leitos e serviços.