O Inep não divulga médias do Enem por estado, município, região ou outros tipos de agregações, isso porque não é possível realizar as ponderações necessárias, considerada a adesão voluntária dos estudantes ao exame.
O Sistema Nacional de Avaliação da Educação Básica, Saeb, desde 1990 avalia o desempenho das redes de ensino de todo o país a partir de uma avaliação amostral que é planejada para a divulgação de resultados representativos por estado, região e outras agregações. Comparações de desempenho entre redes, estados ou dependências administrativas (rede pública, rede particular) devem pautar-se em dados do Saeb, desde que considerados os fatores sociais, econômicos e culturais das redes de ensino. Os resultados do Saeb podem ser interpretados pedagogicamente por meio de uma escala de proficiência.
A partir de 2005, os dados do Saeb passaram a ser utilizados também para o cálculo do Ideb, indicador utilizado pelo Inep para avaliar o desenvolvimento da educação brasileira. Os resultados do Ideb por estado, município, estado e região podem ser acessados em http://portal.inep.gov.br/web/portal-ideb.