
Fez doutorado em teologia pela Universidade Católica de Louvaina e chegou ao Brasil em 1958. Em Recife, a convite de Dom Helder Câmara, foi professor no Instituto de Teologia do Recife.
Padre José Comblin recebeu o título de doutor honoris causa da Universidade Federal da Paraíba (UFPB), em 2001, por seu trabalho no campo da educação popular, desenvolvendo uma metodologia própria, por seus trabalhos pastorais em prol dos oprimidos da América Latina, por sua vasta obra publicada e por seu trabalho como educador e humanista junto à UFPB.
Expulso do Brasil em 1971 pelo regime militar, Padre Comblin exilou-se no Chile durante oito anos, de onde também foi expulso em 1980 pelo general Pinochet. Voltando ao Brasil, foi morar na Paraíba, em Serra Redonda. Estudioso da Igreja da América Latina escreveu obras como a "Teologia da Enxada", uma corrente teológica surgida em 1969 na Igreja Católica do Nordeste do Brasil que tem como base a reflexão a partir da vivência cristã e teológica nas comunidades pobres.
Ele estava escrevendo um livro sobre a relação entre religião e Evangelho. Atualmente morava em Barra, na Bahia.
De acordo com vontade manifestada aos amigos, Padre Comblin será sepultado no Santuário do Padre Ibiapina, localizado em Santa Fé, distrito que faz parte do município de Solânea, na Paraíba.